本网讯(文/帅隆妹 余思瑶 图/彭馨)12月31日下午,中国科学院深圳先进技术研究院研究员张成辛应邀做客我校高岭讲坛,在湘湖校区B2-108报告厅作题为《基于人工智能的蛋白质与RNA功能预测》的讲座,共有100余名师生到场聆听。

讲座中,张成辛以人工智能驱动的生物信息学方法为切入点,深入探讨了其在蛋白质与RNA功能预测领域的核心原理与技术路径。他指出,大多数蛋白质功能预测算法无法直接使用蛋白质的三维结构信息,也无法有效地结合同源序列、三维结构和蛋白质相互作用等多角度的信息。针对这一问题,张成辛重点介绍了自主研发的COFAC-TOR算法,该算法通过结构比对、序列搜索和蛋白质相互作用数据库查找三种方式,在数据库中精准匹配具有功能注释的模板蛋白,从而得出最终的功能注释。他在开发功能预测算法的过程中,还配套开发了基于深度学习的蛋白质结构预测算法,形成了一个完整且多层次的蛋白质结构与功能预测体系,并将其进一步推广到RNA领域。

讲座后,张成辛与在场师生们交流互动,就师生们提出的关于模型选择、经验参数设定、非生物因素应用等方面的问题进行解答。在场师生纷纷表示,讲座内容生动详实、案例丰富,让大家对基于人工智能的蛋白质与RNA功能预测有了更加深入全面的认识。
张成辛,现任中国科学院深圳先进技术研究院研究员,曾任美国密歇根大学的助理研究教授、耶鲁大学博士后、密歇根大学生物信息学博士研究生。国家自然科学基金优秀青年科学基金项目获得者,已发表SCI论文60余篇,总被引6000余次,以第一/通讯作者在NATURE METHODS、NATURE PROTOCOLS、3RIEFINGS INBIOINFORMATICS等期刊发表20篇论文,H因子33。主要研究方向是基于人工智能和蒙特卡罗模拟方法,开发新的蛋白质与RNA的三维结构与生物学功能的预测算法。开发的多个算法已在同行中得到广泛应用,并在国际蛋白结构预测大赛(CRITICAL ASSESSMENT OF STRUCTURE PREDICTION,CASP)、国际蛋白功能注释大赛(CRITICAL ASSESSMENT OF FUNCTION ANNOTATION,CAFA) 等国际赛事中名列前茅。
(责任编辑:刘欢 审稿:兰茜 刘欢)
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